Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ArxO35085 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ArxO35085 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ArxO35085 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ArxO35085 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ArxO35085 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ArxO35085 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ArxO35085 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ArxO35085 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ArxO35085 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ArxO35085 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ArxO35085 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ArxO35085 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ArxO35085 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ArxO35085 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ArxO35085 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ArxO35085 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ArxO35085 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ArxO35085 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ArxO35085 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ArxO35085 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ArxO35085 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ArxO35085 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ArxO35085 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ArxO35085 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ArxO35085 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ArxO35085 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ArxO35085 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ArxO35085 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ArxO35085 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ArxO35085 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ArxO35085 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ArxO35085 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ArxO35085 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ArxO35085 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ArxO35085 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ArxO35085 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ArxO35085 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ArxO35085 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ArxO35085 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ArxO35085 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ArxO35085 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ArxO35085 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ArxO35085 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ArxO35085 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ArxO35085 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ArxO35085 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ArxO35085 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ArxO35085 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ArxO35085 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ArxO35085 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ArxO35085 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ArxO35085 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ArxO35085 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ArxO35085 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ArxO35085 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ArxO35085 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ArxO35085 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ArxO35085 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ArxO35085 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ArxO35085 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ArxO35085 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ArxO35085 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ArxO35085 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ArxO35085 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ArxO35085 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ArxO35085 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ArxO35085 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ArxO35085 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ArxO35085 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ArxO35085 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ArxO35085 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ArxO35085 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ArxO35085 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ArxO35085 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ArxO35085 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ArxO35085 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ArxO35085 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ArxO35085 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ArxO35085 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ArxO35085 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ArxO35085 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ArxO35085 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ArxO35085 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ArxO35085 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ArxO35085 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ArxO35085 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ArxO35085 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms