Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4dO09126 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4dO09126 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4dO09126 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema4dO09126 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4dO09126 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4dO09126 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4dO09126 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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