Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn2O08746 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn2O08746 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Matn2O08746 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn2O08746 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn2O08746 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn2O08746 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn2O08746 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn2O08746 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Matn2O08746 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Matn2O08746 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms