Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ0

Spin2e, Spindlin family, member 2E, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2eJ3QNQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spin2eJ3QNQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spin2eJ3QNQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spin2eJ3QNQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spin2eJ3QNQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin2eJ3QNQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms