Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700014D04RikJ3QMS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
1700014D04RikJ3QMS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
1700014D04RikJ3QMS2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700014D04RikJ3QMS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms