Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,53■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,56
Gm20873J3QMQ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,52■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,5■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18,49■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,48■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Gm20873J3QMQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,45■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18,44■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,42■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,4■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,54
Gm20873J3QMQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
Gm20873J3QMQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
Gm20873J3QMQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
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