Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20830J3KML6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20830J3KML6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20830J3KML6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20830J3KML6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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