Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r39G3UWE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vmn1r39G3UWE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r39G3UWE6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r39G3UWE6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r39G3UWE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r39G3UWE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms