Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm10378F6XQQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm10378F6XQQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm10378F6XQQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm10378F6XQQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm10378F6XQQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm10378F6XQQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms