Protein–RNA interactions for Protein: F6XDR3

Gm10542, Predicted gene 10542, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10542F6XDR3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10542F6XDR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm10542F6XDR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10542F6XDR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10542F6XDR3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms