Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm10722F6VLK5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm10722F6VLK5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm10722F6VLK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm10722F6VLK5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm10722F6VLK5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm10722F6VLK5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms