Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
BC005561E9Q5E2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
BC005561E9Q5E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
BC005561E9Q5E2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
BC005561E9Q5E2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
BC005561E9Q5E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BC005561E9Q5E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
BC005561E9Q5E2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BC005561E9Q5E2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
BC005561E9Q5E2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms