Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pgbd1E9Q492 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pgbd1E9Q492 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pgbd1E9Q492 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pgbd1E9Q492 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pgbd1E9Q492 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms