Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp3E9Q1T6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp3E9Q1T6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp3E9Q1T6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Lrp3E9Q1T6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp3E9Q1T6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp3E9Q1T6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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