Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzd2E9Q1M1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd2E9Q1M1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd2E9Q1M1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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