Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E430018J23RikE9PZQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E430018J23RikE9PZQ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E430018J23RikE9PZQ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E430018J23RikE9PZQ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E430018J23RikE9PZQ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms