Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd2E9PZM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Chd2E9PZM4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Chd2E9PZM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chd2E9PZM4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Chd2E9PZM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chd2E9PZM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Chd2E9PZM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Chd2E9PZM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms