Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ift140E9PY46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ift140E9PY46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ift140E9PY46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ift140E9PY46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ift140E9PY46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ift140E9PY46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ift140E9PY46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ift140E9PY46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ift140E9PY46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ift140E9PY46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Ift140E9PY46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ift140E9PY46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ift140E9PY46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Ift140E9PY46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ift140E9PY46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ift140E9PY46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms