Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3lE9PWZ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rpl3lE9PWZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpl3lE9PWZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl3lE9PWZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms