Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20547B8JJN0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20547B8JJN0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20547B8JJN0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm20547B8JJN0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm20547B8JJN0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20547B8JJN0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20547B8JJN0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms