Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol6B7ZC55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Apol6B7ZC55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Apol6B7ZC55 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Apol6B7ZC55 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Apol6B7ZC55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Apol6B7ZC55 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms