Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf11cB4XVP9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf11cB4XVP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf11cB4XVP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms