Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrr3B2RXA8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrr3B2RXA8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrr3B2RXA8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrr3B2RXA8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrr3B2RXA8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrr3B2RXA8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 519.5 ms