Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phactr2B1AVP0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Phactr2B1AVP0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phactr2B1AVP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phactr2B1AVP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Phactr2B1AVP0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Phactr2B1AVP0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phactr2B1AVP0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms