Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2c2A7L9Z8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp2c2A7L9Z8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2c2A7L9Z8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2c2A7L9Z8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2c2A7L9Z8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2c2A7L9Z8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms