Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Frmpd1A2AKB4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Frmpd1A2AKB4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Frmpd1A2AKB4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Frmpd1A2AKB4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Frmpd1A2AKB4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Frmpd1A2AKB4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Frmpd1A2AKB4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Frmpd1A2AKB4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Frmpd1A2AKB4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Frmpd1A2AKB4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms