Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm12A2AJ77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prdm12A2AJ77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prdm12A2AJ77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prdm12A2AJ77 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prdm12A2AJ77 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm12A2AJ77 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm12A2AJ77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms