Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdl2A2AGA4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rhbdl2A2AGA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhbdl2A2AGA4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhbdl2A2AGA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhbdl2A2AGA4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms