Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Itgb4A2A863 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Itgb4A2A863 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Itgb4A2A863 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29,2■■■□□ 2,27
Itgb4A2A863 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Itgb4A2A863 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Itgb4A2A863 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Itgb4A2A863 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Itgb4A2A863 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms