Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc112A0AUP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc112A0AUP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc112A0AUP1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc112A0AUP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc112A0AUP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc112A0AUP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1198.7 ms