Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA5

Gm28961, Predicted gene 28961, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28961A0A087WPA5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Gm28961A0A087WPA5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gm28961A0A087WPA5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gm28961A0A087WPA5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gm28961A0A087WPA5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm28961A0A087WPA5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Gm28961A0A087WPA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Gm28961A0A087WPA5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Gm28961A0A087WPA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Gm28961A0A087WPA5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
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