Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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