Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073657.1-201ENST00000607504 316 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007450.2-201ENST00000614160 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC126915.3-201ENST00000620111 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FAM209B-201ENST00000371325 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNORD83A-201ENST00000386747 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073342.1-201ENST00000427392 592 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC00395-201ENST00000444536 406 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02327-206ENST00000551588 885 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 BOD1P2-201ENST00000578494 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms