Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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