Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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