Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NEUROD1Q13562 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms