Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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