Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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FOXO1Q12778 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXO1Q12778 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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