Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SREBF2Q12772 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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