Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SNORD3G-201ENST00000362796 215 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MED28P1-201ENST00000399158 571 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 TIMM8AP1-201ENST00000419283 295 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AKR1B1P1-201ENST00000429105 956 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC011193.1-202ENST00000441287 323 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL133387.1-201ENST00000442188 382 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC099681.1-201ENST00000454777 552 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC108114.1-201ENST00000477321 437 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ZNF283-205ENST00000590950 466 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC100843.3-201ENST00000591796 259 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 BSNDP3-201ENST00000617487 364 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PLA2G4A-201ENST00000367466 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 FCGR3B-209ENST00000614870 1993 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC122688.4-201ENST00000623279 4394 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 JAZF1-AS1-202ENST00000444500 3684 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SWT1-202ENST00000367501 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 UBE2R2-AS1-201ENST00000454429 647 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC124290.2-201ENST00000519431 286 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LMO3-222ENST00000540445 906 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 BNIP3P15-201ENST00000604600 301 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 C8orf46-201ENST00000305454 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LPAL2-205ENST00000639825 1536 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CACNB1Q02641 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC104051.2-201ENST00000518934 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 DNAH11-212ENST00000620169 13670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TMEM108-AS1-202ENST00000505721 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNCA-206ENST00000420646 3127 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 NCAPD2P1-201ENST00000432906 1801 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms