Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms