Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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