Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms