Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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