Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
EFNB3Q15768 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms