Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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