Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB39AQ14964 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms