Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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