Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms