Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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